Las máquinas Motorola 680x0 generalmente se autoconfiguran y no requieren configuración de «firmware». Sin embargo, debe asegurarse de tener la ROM y los parches del sistema apropiados. En Macintosh, se recomienda MacOS versión >= 7.1 debido a que la versión 7.0.1 tiene un fallo de los controladores de vídeo que impiden al gestor de arranque desactivar las interrupciones de vídeo, lo que resulta en un colapso del arranque. En sistemas BVM VMEbus debe asegurarse que está usando BVMBug revisión G o superior del boot ROM. El boot ROM BVMBug no viene como estándar en los sistemas BVM pero puede solicitarlos de BVM y los obtendrá sin coste alguno.

Muchas personas han intentado hacer funcionar su sistema de 90 MHz a 100 MHz, etc. Habitualmente esto funciona, pero es sensible a la temperatura y otros factores y de hecho podría dañar su sistema. Uno de los autores de este documento forzó la velocidad de su sistema durante un año y luego el sistema empezó a abortar el programa gcc con una señal inesperada mientras estaba compilando el núcleo del sistema operativo. Cambiar la velocidad del procesador a su valor original solucionó el problema.

Frecuentemente lo primero que falla debido a módulos de memoria defectuosos (u otros problemas de hardware relacionados que pueden cambiar la información impredeciblemente) es el compilador gcc, ya que este construye grandes estructuras de datos que analiza repetidamente. Un error en estas estructuras de datos causará una ejecución de una instrucción ilegal o acceso a una dirección inexistente. El síntoma de esto es un fallo del programa gcc con una señal inesperada.

Las placas de RAM de Atari TT son notables por los problemas de RAM en Linux, si encuentra cualquier problema extraño intente ejecutar al menos el núcleo en ST-RAM. Los usuarios de Amiga podrían necesitar excluir la RAM usando un fichero de memoria de arranque.